Ordynacja podatkowa wymusza na przedsiębiorcach przechowywanie ksiąg rachunkowych i dokumentów z nimi związanych przez okres 5 lat , czyli do końca okresu przedawnienia zobowiązania podatkowego.
Okres ten obejmuje dany rok podatkowy, a nie poszczególne daty wystawienia dokumentów.
Zeznanie roczne stanowi wyjątek, ponieważ okres ochrony kończy się z upływem 5 lat, liczonych od końca roku, w którym zostało złożone. Sprawozdania finansowe zgodnie z ustawą o rachunkowości muszą być przechowywane bezterminowo.
Wśród dokumentów związanych z księgowością wyróżnia się dokumenty tj. księga przychodów i rozchodów (podmioty rozliczane na zasadach ogólnych lub podatkiem liniowym), ewidencja przychodów (podmioty rozliczane ryczałtem), ewidencja środków trwałych, wyposażenia, dowody księgowe (faktury, noty, dowody wewnętrzne), dokumenty dotyczące inwentaryzacji.